La Fundación Pastor tiene su sede social en la calle Serrano 107 de Madrid. El edificio, situado en una parcela de 1.305,42 m2, tiene una superficie construida de 1.227 m2. Se empezó a construir en 1927 con planos de Amós Salvador Carreras. Fue domicilio de Antonio Pastor y de su esposa hasta 1971, y de su viuda hasta 1991.
Dispone de una sala de conferencias con aforo para setenta y una personas, de un aula equipada con medios audiovisuales para treinta personas, de una sala de reuniones para quince personas, de una biblioteca especializada en el mundo clásico con puestos de trabajo para investigadores, de una papiroteca, de un espacio de lectura y de varios despachos. La Fundación mantiene una base de datos con el nombre y las direcciones postal y electrónica de las personas que han impartido o asistido a algún curso. Se envían anuncios de cada actividad programada a las personas que figuran en la base de datos. La sede social acoge también actividades organizadas por entidades con fines análogos.